Yeni Amasyaspor Kulübü, 1968 yılında Amasya'da kurulmuş bir Türk futbol kulübüdür. Kulüp, şu anda Bölgesel Amatör Lig'de mücadele etmektedir.
Yeni Amasyaspor, 1968 yılında, Amasya'nın önde gelen spor kulüplerinden biri olan Amasyaspor'un dağılması sonucu kurulmuştur. Kulübün ilk başkanı, Amasyaspor'un eski başkanı olan Mehmet Ali Yılmaz'dır.
Yeni Amasyaspor, kurulduğu günden bu yana Bölgesel Amatör Lig'de mücadele etmektedir. Kulüp, 1993-94 sezonunda Bölgesel Amatör Lig'de şampiyon olarak 3. Lig'e yükselmiştir. Ancak, kulüp 3. Lig'de sadece bir sezon mücadele edebilmiş ve 1994-95 sezonunda tekrar Bölgesel Amatör Lig'e düşmüştür.
Yeni Amasyaspor, Bölgesel Amatör Lig'de mücadele ettiği yıllarda birçok önemli başarıya imza atmıştır. Kulüp, 2004-05 sezonunda Bölgesel Amatör Lig'de şampiyon olarak 3. Lig'e yükselmiştir. Ancak, kulüp 3. Lig'de yine sadece bir sezon mücadele edebilmiş ve 2005-06 sezonunda tekrar Bölgesel Amatör Lig'e düşmüştür.
Yeni Amasyaspor, 2010-11 sezonunda Bölgesel Amatör Lig'de şampiyon olarak 3. Lig'e yükselmiştir. Kulüp, bu kez 3. Lig'de iki sezon mücadele edebilmiş ve 2012-13 sezonunda 2. Lig'e yükselmiştir.
Yeni Amasyaspor, 2. Lig'de mücadele ettiği yıllarda birçok önemli başarıya imza atmıştır. Kulüp, 2014-15 sezonunda 2. Lig'de şampiyon olarak 1. Lig'e yükselmiştir. Ancak, kulüp 1. Lig'de sadece bir sezon mücadele edebilmiş ve 2015-16 sezonunda tekrar 2. Lig'e düşmüştür.
Yeni Amasyaspor, 2016-17 sezonunda 2. Lig'de şampiyon olarak tekrar 1. Lig'e yükselmiştir. Kulüp, bu kez 1. Lig'de iki sezon mücadele edebilmiş ve 2018-19 sezonunda Süper Lig'e yükselmiştir.
Yeni Amasyaspor, Süper Lig'de mücadele ettiği yıllarda birçok önemli başarıya imza atmıştır. Kulüp, 2019-20 sezonunda Süper Lig'de şampiyon olmuştur. Bu başarı, kulübün tarihindeki en büyük başarıdır.
Yeni Amasyaspor, 2020-21 sezonunda Süper Lig'de mücadele etmektedir. Kulüp, şu anda ligde orta sıralarda yer almaktadır.