Il Football Club Tokyo (FC東京?, Efushī Tōkyō), meglio noto come FC Tokyo, è una società calcistica giapponese con sede nella città di Tokyo. Milita nella J1 League, la massima divisione del campionato giapponese.
La squadra venne fondata nel 1935 con il nome di Tokyo Gas Football Club (東京ガスFC) ed era il team ufficiale dell'omonima compagnia Tokyo Gas.
Il 1º ottobre 1998, importanti compagnie come Tokyo Gas, TEPCO, ampm, TV Tokyo e Culture Convenience Club diedero vita al Tokyo Football Club Company, con l'obiettivo di portare la squadra ai vertici del calcio nazionale. Nel 1999 l'FC Tokyo vinse la seconda divisione della J. League, guadagnandosi così la promozione nella massima serie nipponica. La prima stagione in J. League 1, quella del 2000, fu tutto sommato positiva, infatti il club di Tokyo concluse il campionato al 7º posto.
I buoni risultati della squadra attirarono un numero sempre più alto di tifosi, tanto da superare la media spettatori del Tokyo Verdy 1969. Sin dal 2002 la dirigenza scelse Hiromi Hara come allenatore, il quale portò il club a un eccellente quarto posto nella stagione 2003 (si tratta tuttora del miglior piazzamento nella storia della squadra). Nell'agosto dello stesso anno venne organizzata un'amichevole di lusso con il Real Madrid, persa per 3-0.
Il leader della squadra, il brasiliano Wagner Pereira Cardozo detto Amaral, soprannominato dai tifosi Il Re di Tokyo, lasciò il club nel 2004 per accasarsi al Shonan Bellmare. Il suo posto fu preso da Yasuyuki Konno, proveniente dal Consadole Sapporo. Nel novembre dello stesso anno, l'FC Tokyo vinse la Coppa Yamazaki Nabisco, il primo trofeo nazionale nella storia della squadra. Nel 2011, si aggiudicò invece la sua prima Coppa dell'Imperatore, qualificandosi di diritto alla Champions League asiatica dell'anno successivo.