L'FC Koper U19 è una squadra di calcio slovena con sede a Capodistria. Fondata nel 1950, è la squadra giovanile dell'FC Koper.

La squadra gioca le sue partite casalinghe allo stadio Bonifika di Capodistria.

L'FC Koper U19 ha vinto il campionato sloveno U19 per quattro volte, nel 2006, 2007, 2008 e 2010.

La squadra ha anche partecipato alla UEFA Youth League in quattro occasioni, nel 2011-12, 2012-13, 2013-14 e 2014-15.

L'FC Koper U19 è una delle squadre giovanili più forti della Slovenia e ha prodotto numerosi giocatori che hanno poi giocato per la nazionale slovena.