La categoria è stata introdotta per la prima volta nel 2013.
Sono 41 le squadre ad aver preso parte alle 12 stagioni dell'Esiliiga B dal 2013 al 2024. In grassetto le squadre partecipanti all'Esiliiga B 2024.
- 8 volte: Kalju Nõmme U21
- 7 volte: Kalev Tallinn U21
- 6 volte: Alliance Ida-Virumaa, Tammeka Tartu U21
- 5 volte: Flora Tallinn U19, Kalev Sillamäe U21, Läänemaa, Viimsi
- 4 volte: Elva, Paide U21, Pärnu JK, Tabasalu, TJK Legion, Vaprus Vändra, Welco Tartu
- 3 volte: Ararat/TTÜ, Helios Võru, HÜJK Emmaste, Joker Raasiku, Kalev Tartu, Keila
- 2 volte: FC Tallinn, Kuressaare U21, Maardu, Nõmme United, TJK Legion U21, Trans Narva U21, Tulevik Viljandi
- 1 volta: Ajax Lasnamäe, Dünamo Tallinn, FCI Tallinn U21, Harju Laagri, Kuressaare, Phoenix Jõhvi, Puuma Tallinn, Raplamaa, Santos Tartu, Tarvas Rakvere, Tulevik Viljandi 2, Vaprus Pärnu, Volta Põhja-Tallinn.