Il Mesquita Futebol Clube è una squadra di calcio brasiliana della città di Mesquita, nello stato di Rio de Janeiro. Fu fondata il 22 giugno 1994, e gioca i suoi match casalinghi presso l'Estádio Nivaldo Pereira, con una capienza di 5.000 spettatori. Attualmente disputa il Campeonato Carioca Série B2, dopo la retrocessione dalla Série B1 avvenuta nel 2017.
Nei primi anni di attività, il Mesquita ha partecipato a diversi campionati regionali, ottenendo discreti risultati. Nel 2001, la squadra ha raggiunto la finale del Campeonato Carioca Série C, ma è stata sconfitta ai rigori dall'Estácio de Sá. Nel 2006, il Mesquita ha vinto il Campeonato Carioca Série B2, ottenendo così la promozione in Série B1.
Nel 2007, la squadra ha raggiunto la finale della Copa Rio, ma è stata sconfitta dal Madureira. Tuttavia, grazie a questo risultato, il Mesquita ha ottenuto la qualificazione alla Coppa del Brasile 2008, dove ha raggiunto il secondo turno, venendo eliminato dal Botafogo.
Nel 2010, il Mesquita ha vinto il Campeonato Carioca Série B1, ottenendo così la promozione in Série A. Tuttavia, la permanenza in massima serie è durata solo una stagione, e nel 2011 la squadra è retrocessa in Série B1.
Negli ultimi anni, il Mesquita ha continuato a partecipare ai campionati regionali, ottenendo risultati alterni. Nel 2017, la squadra è retrocessa in Série B2, e attualmente milita in questa categoria.