Il Futboll Klub Kukësi, meglio noto come Kukësi, è una società calcistica albanese con sede nella città di Kukës.
Dalla stagione 2012-2013 milita nella Kategoria Superiore, la massima divisione del campionato albanese.
Il club venne fondato nel 1930. Terminata la stagione 2011-2012 in Kategoria e Parë e classificandosi come 2°, ottiene la sua prima storica promozione nella massima serie del campionato albanese. Arriva ad ottenere un altro successo in Europa League, dove arriva a giocarsi i play-off decisivi per l'accesso alla fase a gironi, venendo eliminata dalla squadra turca del Trabzonspor, venendo sconfitta sia all'andata per 2-0 che al ritorno per 3-1. Invece nella stagione 2014-2015 in Kategoria Superiore conclude il campionato come 2ª classificata. Il 22 maggio 2016 vince la sua prima Coppa d'Albania. Nella stagione 2016-2017 vince per la prima volta sia la Supercoppa d'Albania che la Kategoria Superiore.