La squadra di calcio giovanile del Panathinaikos U20 è la squadra di calcio giovanile dell'omonimo club greco. Milita nella Super League greca 2, la seconda divisione del campionato greco di calcio.
La squadra è stata fondata nel 1962 e ha vinto il campionato greco per quattro volte, nel 1970, 1977, 1980 e 1982. Ha inoltre vinto la Coppa di Grecia per due volte, nel 1969 e nel 1977.
Il Panathinaikos U20 è una delle squadre giovanili più titolate della Grecia e ha prodotto molti giocatori che hanno poi militato nella nazionale greca, tra cui Giorgos Karagounis, Angelos Basinas e Dimitrios Papadopoulos.
La squadra gioca le sue partite casalinghe allo stadio Apostolos Nikolaidis, che ha una capienza di 16.000 spettatori.
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