L'Indy Eleven è una società calcistica professionstica statunitense con sede nella città di Indianapolis, in Indiana, che disputa le proprie partite interne presso il Michael A. Carroll Track & Soccer Stadium, impianto dotato di una capienza di 12.000 posti a sedere.
Attualmente milita nella USL Championship, la seconda divisione del campionato statunitense.
Il 16 gennaio 2013 la North American Soccer League, l'allora seconda divisione del campionato statunitense, annunciò l'ingresso di una nuova squadra nella lega con sede ad Indianapolis a partire dalla stagione successiva. Il nome, lo stemma ed i colori ufficiali del club furono rivelati al pubblico il 25 aprile dello stesso anno. A novembre 2013 la società annunciò di aver venduto tutti gli oltre 7.000 abbonamenti messi in vendita, diventando così la prima squadra della storia della NASL ad avere una lista d'attesa per gli abbonamenti.
Il club debuttò ufficialmente l'11 aprile 2014 in un pareggio per 1-1 contro i Carolina Railhawks davanti ad un pubblico di casa di 11.048 spettatori.
La squadra vinse il suo primo trofeo ufficiale conquistando, da imbattuta, la Spring Season della NASL nel 2016. Nei playoff di fine stagione, l'Indy Eleven, dopo aver superato 1-0 l'Edmonton in semifinale, dovette però arrendersi ai calci di rigore ai New York Cosmos.
Il 10 gennaio 2018, la società annunciò di aver lasciato la NASL e di essersi invece iscritta alla United Soccer League, nel frattempo diventata l'unica lega di seconda divisione statunitense, per la stagione 2018. Il club debuttò ufficialmente nella nuova lega il 24 marzo 2018 sconfiggendo in trasferta i Richmond Kickers con il risultato di 1-0. Al termine della prima stagione in USL la squadrà riuscì a qualificarsi per i playoff, ma uscì sconfitta al primo turno dai rivali del Louisville City con un netto 4-1.
Nella stagione successiva, il club, dopo aver eliminato sia il N.Y. Red Bulls II che il Nashville con il risultato di 1-0, riuscì a raggiungere la finale di Eastern Conference, dove però fu nuovamente sconfitto dal Louisville City, stavolta per 3-1 dopo i tempi supplementari.
Il 31 gennaio 2017, il club annunciò i suoi tentativi di ottenere una franchigia di Major League Soccer entro il 2020. Gli sforzi si rivelarono tuttavia vani. Nonostante ciò, il club, nella persona di Greg Stremlaw, a seguito dell'ingresso del Charlotte nel dicembre 2019 nella massima serie calcistica nordamericana, rese noto che avrebbe continuato a lavorare per portare l'Indy Eleven nella MLS.