Il Querétaro Fútbol Club U20 è una squadra calcistica messicana, con sede a Querétaro, che milita nella Serie A, seconda divisione del campionato messicano di calcio. La squadra è stata fondata nel 2007 e rappresenta il settore giovanile del Querétaro Fútbol Club.

Lo stadio di casa del Querétaro U20 è lo Estadio Corregidora, che ha una capacità di 35.575 spettatori. L'allenatore attuale della squadra è David Patiño.

Il Querétaro U20 ha vinto il campionato di Serie A una volta, nella stagione 2014-2015. La squadra ha anche raggiunto la finale della Coppa del Messico U20 una volta, nella stagione 2016-2017.

Il Querétaro U20 è una delle squadre giovanili più forti del Messico e ha prodotto molti giocatori che hanno poi militato nella prima squadra del Querétaro Fútbol Club e della nazionale messicana. Alcuni dei giocatori più famosi ad aver giocato nel Querétaro U20 includono:

* Érick Gutiérrez
* Hirving Lozano
* Diego Lainez
* Edson Álvarez
* Orbelín Pineda